# Éditer un protocole

Sur cet écran on peut créer ou éditer un protocole. Le protocole est lié à une série. Ensuite, associé à une campagne, il permet d'initialiser les écrans de saisie afin, de faciliter la saisie des données, d’accélérer la saisie et de limiter les risques d'erreurs à la saisie.

## Onglet informations générales

### Description des champs

Nom
  nom du protocole. Sa valeur est unique dans la base
Commentaire
  permet d'ajouter un commentaire libre sur le protocole

### Description des actions

Fermer
  permet de quitter l'écran d'édition du protocole
Enregistrer
  permet d'enregistrer toutes les modifications du protocole

## Onglet Caractéristiques

### Description des champs

Sous onglet Classes de taille
  Fonctionnement via le principe de la double liste. Basculer dans la colonne de droite toutes les méthodes de mensuration qui pourront être utilisées à la saisie. Le champ du dessus permet de faire une recherche textuelle. Seules les méthodes listées dans ce champ seront disponibles dans l'onglet « Espèces » et « Benthos » du protocole ainsi que dans la phase de saisie des mensurations des lots et des individus. Il est donc important d'être exhaustif dans la constitution de cette liste. Cependant, si en cours de saisie il apparaît qu'il manque une référence, il est possible de revenir sur cet onglet pour enrichir la liste.
Sous onglet Observations individuelles
  Fonctionnement via le principe de la double liste. Basculer dans la colonne de droite toutes les caractéristiques qui seront observées sur les individus conformément au protocole technique de la campagne. Les colonnes par défaut dans le tableau "Observations individuelles" sont Poids, Taille et Classe de taille. Si en cours de saisie il venait à manquer une caractéristique, elle peut être ajoutée en cours de saisie par modification du protocole ou sinon être saisie dans la colonne du tableau "Observations individuelles" dans la colonne "Autres caractéristiques".
Sous onglet Maturité
  Cette onglet permet de lister les échelles de maturité qui seront exploitées dans le cadre des observations individuelles et éventuellement dans l'algorithme de prélèvement des paramètres individuels.
Sous onglet Caractéristiques du trait
  Cette onglet permet de lister les caractéristiques qui seront à renseigner sur chacun des traits. De plus il est possible de configurer l’application pour renseigner ces caractéristiques par import d’un fichier de type csv.

### Description des actions

Import les caractéristiques
  permet d'importer un fichier .csv (encodage UTF8, séparateur « ; ») contenant les caractéristiques à lister dans la colonne de droite (pour tous les sous onglets).
Exporter les caractéristiques
  permet d'exporter un fichier .csv (encodage UTF8, séparateur « ; ») contenant les caractéristiques listées dans la colonne de droite (pour tous les sous onglets).
Exporter toutes les caractéristiques
  permet d'exporter un fichier .csv (encodage UTF8, séparateur « ; ») contenant les caractéristiques du référentiel.
Importer le fichier de paramètres
  permet d’importer la structure du fichier (titre des colonnes) qui contiendra les caractéristiques des traits.

## Onglet Espèces

Cette écran permet de lister les espèces (hors benthos) couramment observées et le type d'observations à réaliser sur les lots conformément au protocole technique de la campagne.

### Description des champs

Espèce
  CODE RUBIN – nom scientifique de l'espèce observée. Ce champ est renseigné à partir de la liste déroulante située en haut du tableau. Sélectionner une espèce et ajouter la valeur en cliquant sur [+]. Un clic droit sur le titre de la colonne permet de modifier l'ordre Code Rubin - nom scientifique ou inversement. Un clic sur le titre de la colonne permet de déclencher un tri par ordre alphabétique.
Code campagne
  code campagne de l'espèce utilisé au cours de la campagne. Un clic sur le titre de la colonne permet de déclencher un tri par ordre alphabétique.
Mode de mensuration
  si l'espèce est mesurée, renseigner la méthode de mensuration de l'espèce. Les valeurs possibles pour ce champ sont celles listées dans l'onglet « Caractéristiques », sous onglet « Classes de taille ».
PSFM de maturité
  permet d'associer à chaque espèce, le type d'échelle de maturité adapté. L'échelle aura été préalablement listé dans l'écran Caractéristiques/Maturité.
Type de pièce calcifiée
  permet de préciser, le cas échéant, le type de pièce calcifiée qui sera prélevée sur l'espèce.
Pesée
  case cochée si l'espèce doit être pesée.
Class Tri
  case cochée si le critère de classe de taille (petit gros...) est potentiellement utilisé pour décrir le lot de l'espèce.
...
  D'autre colonnes peuvent apparaitre dans ce tableau en fonction de la configuration définie dans le menu "Administration/Configurer les catégorisations"
Obs Indiv.
  case cochée si des observations individuelles seront réalisée sur l'espèce.
RTP
  permet d'enregistrer les coefficients a et b, cela afin d'offrir la possibilité d'avoir des poids calculés par relation taille poids dans l'écran des mensurations.

Prélèvement de pièce calcifiées
  case cochée si, pour les observations individuelles, un prélèvement de pièces calcifiées est prévu au protocole.

Un clic droit + [supprimer les espèces] sur une ligne (ou plusieurs par sélections multiples) permet de supprimer une(des) ligne(s).

### Description des actions

Importer les espèces
  permet d'importer un fichier .csv (encodage UTF8, séparateur « ; ») qui complète (et écrase) toutes les informations du tableau.
Exporter les espèces
  permet d'exporter un fichier .csv (encodage UTF8, séparateur « ; ») qui contient toutes les informations du tableau.
Export Pupitri
  génère un fichier qui contient la liste des espèces du protocole afin de mettre à jour le référentiel des espèces de Pupitri (sur le navire océanographique Thalassa).

## Onglet Benthos

Cette écran permet de lister les espèces couramment observées dans la fraction benthos. Pour chaque espèce, on précise le type d'observations à réaliser sur les lots conformément au protocole technique de la campagne.

Le fonctionnement de cet écran est similaire à l'écran sur les espèces. S'y référer pour les fonctionnalités.

### Description des champs

Voir les champs des espèces.

### Description des actions

Voir les actions des espèces.

## Onglet Prélèvements de paramètres individuels

Cette écran permet d'activer et de gérer les paramètres de l'algorythme. Consulter le guide pour une description complète de ces écrans.