fr.ifremer.adagio.core.dao.referential.taxon

Class TaxonName

java.lang.Object

fr.ifremer.adagio.core.dao.referential.taxon.TaxonName

All Implemented Interfaces:

Serializable

Direct Known Subclasses:

TaxonNameImpl

public abstract class TaxonName
extends Object
implements Serializable

Classe regroupant les taxons. Il s'agit en fait d'une combinaison entre un rang taxinomique, un nom de taxon, un code et éventuellement un auteur et une date.

Cette classe regroupe les taxons valides, provisoires, obsolètes, virtuels et les synonymes.

On garde l'historique du passage en taxon valide, puis du passage en synonyme (date de fin référent).

Dans COST : "Use the FAO reference list ftp://ftp.fao.org/FI/stat/data/ASFIS_sp.zip"

See Also:

Serialized Form

Nested Class Summary

Nested Classes

Modifier and Type	Class and Description
static class	TaxonName.Factory Constructs new instances of TaxonName.

Constructor Summary

Constructors

Constructor and Description
TaxonName()

Method Summary

Methods

Modifier and Type	Method and Description
boolean	equals(Object object) This entity does not have any identifiers and is not extending any other entity, so this method will only return true if the argument reference and this refer to the same object.
Collection<TaxonName>	getChildTaxonNames()
Citation	getCitation()
String	getComments() Commentaire associé au libellé du taxon.
String	getCompleteName()
Date	getCreationDate() Date de création système du libellé.
Date	getEndDate() Date où le libellé n'est plus référent et a été remplacé par un autre libellé.
Integer	getId() Identifiant système unique du libellé.
Boolean	getIsNaming() Indique si les regles de nomenclature sont à appliquer.
Boolean	getIsObsolete() Indique qu’un taxon est obsolète
Boolean	getIsReferent()
Boolean	getIsTemporary() Un libellé peut être provisoire (sp1,sp2 etc.)
Boolean	getIsVirtual()
String	getName() Nom latin présent dans la nomenclature du libellé.
TaxonName	getParentTaxonName()
Collection<TaxonNameHistory>	getParentTaxonNameHistory()
ReferenceTaxon	getReferenceTaxon()
Date	getStartDate() Date à laquelle le taxon est devenu valide.
Collection<TaxonNameHistory>	getTaxonNamehistory()
TaxonomicLevel	getTaxonomicLevel()
Timestamp	getUpdateDate() Date de mise à jour système du libellé.
Integer	getUpperRank() Ce numéro d'ordre du taxon dans l'arbre phylogénique permet de classer les fils d'un même taxon père et donc l'ensemble des taxons valides les uns par rapport aux autres.
int	hashCode() Returns a hash code based on this entity's identifiers.
void	setChildTaxonNames(Collection<TaxonName> childTaxonNames)
void	setCitation(Citation citation)
void	setComments(String comments)
void	setCompleteName(String completeName)
void	setCreationDate(Date creationDate)
void	setEndDate(Date endDate)
void	setId(Integer id)
void	setIsNaming(Boolean isNaming)
void	setIsObsolete(Boolean isObsolete)
void	setIsReferent(Boolean isReferent)
void	setIsTemporary(Boolean isTemporary)
void	setIsVirtual(Boolean isVirtual)
void	setName(String name)
void	setParentTaxonName(TaxonName parentTaxonName)
void	setParentTaxonNameHistory(Collection<TaxonNameHistory> parentTaxonNameHistory)
void	setReferenceTaxon(ReferenceTaxon referenceTaxon)
void	setStartDate(Date startDate)
void	setTaxonNamehistory(Collection<TaxonNameHistory> taxonNamehistory)
void	setTaxonomicLevel(TaxonomicLevel taxonomicLevel)
void	setUpdateDate(Timestamp updateDate)
void	setUpperRank(Integer upperRank)

Methods inherited from class java.lang.Object

clone, finalize, getClass, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

Constructor Detail

TaxonName

public TaxonName()

Method Detail

getId

public Integer getId()

Identifiant système unique du libellé.

setId

public void setId(Integer id)

getName

public String getName()

Nom latin présent dans la nomenclature du libellé. Il obéit aux règles de la concaténation du libellé décrites dans le règle [R0018].

setName

public void setName(String name)

getCompleteName

public String getCompleteName()

setCompleteName

public void setCompleteName(String completeName)

getIsNaming

public Boolean getIsNaming()

Indique si les regles de nomenclature sont à appliquer.

setIsNaming

public void setIsNaming(Boolean isNaming)

getIsReferent

public Boolean getIsReferent()

setIsReferent

public void setIsReferent(Boolean isReferent)

getUpperRank

public Integer getUpperRank()

Ce numéro d'ordre du taxon dans l'arbre phylogénique permet de classer les fils d'un même taxon père et donc l'ensemble des taxons valides les uns par rapport aux autres. Il permet notamment de gérer les ordre d'affichage suivant l'ordre taxinomique.

setUpperRank

public void setUpperRank(Integer upperRank)

getIsVirtual

public Boolean getIsVirtual()

setIsVirtual

public void setIsVirtual(Boolean isVirtual)

getIsObsolete

public Boolean getIsObsolete()

Indique qu’un taxon est obsolète

setIsObsolete

public void setIsObsolete(Boolean isObsolete)

getIsTemporary

public Boolean getIsTemporary()

Un libellé peut être provisoire (sp1,sp2 etc.)

setIsTemporary

public void setIsTemporary(Boolean isTemporary)

getStartDate

public Date getStartDate()

Date à laquelle le taxon est devenu valide. Cette date peut être vide si le libellé n'a jamais été valide. Cette date est renseignée automatiquement par le système.

setStartDate

public void setStartDate(Date startDate)

getEndDate

public Date getEndDate()

Date où le libellé n'est plus référent et a été remplacé par un autre libellé. Cette date est renseignée automatiquement par le système.

setEndDate

public void setEndDate(Date endDate)

getComments

public String getComments()

Commentaire associé au libellé du taxon.

setComments

public void setComments(String comments)

getCreationDate

public Date getCreationDate()

Date de création système du libellé. Renseigné automatiquement par le système.

setCreationDate

public void setCreationDate(Date creationDate)

getUpdateDate

public Timestamp getUpdateDate()

Date de mise à jour système du libellé. Renseigné automatiquement par le système.

setUpdateDate

public void setUpdateDate(Timestamp updateDate)

getCitation

public Citation getCitation()

setCitation

public void setCitation(Citation citation)

getReferenceTaxon

public ReferenceTaxon getReferenceTaxon()

setReferenceTaxon

public void setReferenceTaxon(ReferenceTaxon referenceTaxon)

getTaxonNamehistory

public Collection<TaxonNameHistory> getTaxonNamehistory()

setTaxonNamehistory

public void setTaxonNamehistory(Collection<TaxonNameHistory> taxonNamehistory)

getParentTaxonNameHistory

public Collection<TaxonNameHistory> getParentTaxonNameHistory()

setParentTaxonNameHistory

public void setParentTaxonNameHistory(Collection<TaxonNameHistory> parentTaxonNameHistory)

getChildTaxonNames

public Collection<TaxonName> getChildTaxonNames()

setChildTaxonNames

public void setChildTaxonNames(Collection<TaxonName> childTaxonNames)

getParentTaxonName

public TaxonName getParentTaxonName()

setParentTaxonName

public void setParentTaxonName(TaxonName parentTaxonName)

getTaxonomicLevel

public TaxonomicLevel getTaxonomicLevel()

setTaxonomicLevel

public void setTaxonomicLevel(TaxonomicLevel taxonomicLevel)

equals

public boolean equals(Object object)

This entity does not have any identifiers and is not extending any other entity, so this method will only return true if the argument reference and this refer to the same object.

Overrides:

equals in class Object

hashCode

public int hashCode()

Returns a hash code based on this entity's identifiers.

Overrides:

hashCode in class Object