nc.ird.cantharella.service.services.impl

Class TestBioServiceImpl

java.lang.Object

nc.ird.cantharella.service.services.impl.TestBioServiceImpl

All Implemented Interfaces:

TestBioService

@Service
public final class TestBioServiceImpl
extends Object
implements TestBioService

Implémentation du service test

Author:

Adrien Cheype

Constructor Summary

Constructors

Constructor and Description
TestBioServiceImpl()

Method Summary

Methods

Modifier and Type	Method and Description
long	countResultatsTestsBio() Compte le nombre de resultats de tests biologiques
void	createErreurTest(nc.ird.cantharella.data.model.ErreurTestBio erreurTest) Créée une erreur pour un test biologique
void	createMethodeTestBio(nc.ird.cantharella.data.model.MethodeTestBio methode) Créée une méthode pour un test biologique
void	createTestBio(nc.ird.cantharella.data.model.TestBio testBio) Créée une manipulation de testBio
void	deleteErreurTest(nc.ird.cantharella.data.model.ErreurTestBio erreurTest) Supprime une erreur pour un test biologique
void	deleteMethodeTestBio(nc.ird.cantharella.data.model.MethodeTestBio methode) Supprime une méthode pour un test biologique
void	deleteTestBio(nc.ird.cantharella.data.model.TestBio testBio) Supprime une manipulation de testBio
boolean	isResultatTestBioAccessibleByUser(nc.ird.cantharella.data.model.ResultatTestBio resultatTestBio, nc.ird.cantharella.data.model.Utilisateur utilisateur) Détermine si un utilisateur peut accéder à un résultat de test biologique
boolean	isResultatTestBioUniqueInList(nc.ird.cantharella.data.model.ResultatTestBio resultatTestBio, List<nc.ird.cantharella.data.model.ResultatTestBio> list) Détermine si un résultat est unique par rapport à une une liste (si blanc : unicité sur repère, si témoin : unicité sur repère + produit_témoin, si produit : unicité sur repère + produit)
boolean	isTestBioUnique(nc.ird.cantharella.data.model.TestBio testBio) Vérifie si le test biologique de référence donnée est unique dans la base
List<String>	listDomainesMethodes() Liste les domaines existants pour les méthodes de test
List<nc.ird.cantharella.data.model.ErreurTestBio>	listErreursTestBio() Liste les erreurs existantes pour un test biologique
List<nc.ird.cantharella.data.model.MethodeTestBio>	listMethodesTestBio() Liste les méthodes existantes pour un test biologique (triés par nom)
List<String>	listProduitsTemoins() Liste les produits témoins existants pour les résultats de tests biologiques
List<nc.ird.cantharella.data.model.ResultatTestBio>	listResultatsTestBio(nc.ird.cantharella.data.model.Utilisateur utilisateur) Liste l'ensemble des résultats de tests biologiques selon les droits d'un utilisateur (triés par réf produit)
SortedSet<nc.ird.cantharella.data.model.ResultatTestBio>	listResultatsTestBioForUser(nc.ird.cantharella.data.model.Utilisateur utilisateur) Liste l'ensemble des résultats de tests biologiques selon les droits d'un utilisateur (triés par réf produit)
List<String>	listUnitesResultatMethodes() Liste les unités de résultat existants pour les méthodes de test
nc.ird.cantharella.data.model.ErreurTestBio	loadErreurTestBio(Integer idErreurTest) Charge une erreur pour un test biologique
nc.ird.cantharella.data.model.ErreurTestBio	loadErreurTestBio(String nom) Charge une erreur pour un test biologique
nc.ird.cantharella.data.model.MethodeTestBio	loadMethodeTest(Integer idMethode) Charge une méthode pour un test biologique
nc.ird.cantharella.data.model.MethodeTestBio	loadMethodeTest(String nom) Charge une méthode pour un test biologique
nc.ird.cantharella.data.model.TestBio	loadTestBio(Integer idTestBio) Charge une manipulation de test biologique
nc.ird.cantharella.data.model.TestBio	loadTestBio(String nom) Charge une manipulation de test biologique
void	refreshMethodeTestBio(nc.ird.cantharella.data.model.MethodeTestBio methode) Rafraichit une méthode de testBio (pour éviter des LazyLoadingException)
void	refreshTestBio(nc.ird.cantharella.data.model.TestBio testBio) Rafraichit une testBio (pour éviter des LazyLoadingException)
void	updateErreurTestBio(nc.ird.cantharella.data.model.ErreurTestBio erreurTest) Met à jour une erreur pour un test biologique
void	updateMethodeTest(nc.ird.cantharella.data.model.MethodeTestBio methode) Met à jour une méthode pour un test biologique
boolean	updateOrdeleteTestBioEnabled(nc.ird.cantharella.data.model.TestBio testBio, nc.ird.cantharella.data.model.Utilisateur utilisateur) Détermine si un utilisateur peut modifier ou supprimer un test biologique
void	updateTestBio(nc.ird.cantharella.data.model.TestBio testBio) Met à jour une manipulation de test biologique

Methods inherited from class java.lang.Object

clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

Constructor Detail

TestBioServiceImpl

public TestBioServiceImpl()

Method Detail

countResultatsTestsBio

public long countResultatsTestsBio()

Compte le nombre de resultats de tests biologiques

Specified by:

countResultatsTestsBio in interface TestBioService

Returns:

Nombre de resultats de tests biologiques

createTestBio

public void createTestBio(nc.ird.cantharella.data.model.TestBio testBio)
                   throws nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataConstraintException

Créée une manipulation de testBio

Specified by:

createTestBio in interface TestBioService

Parameters:

testBio - La manipulation

Throws:

nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataConstraintException - Si la manipulation (réf) existe déjà

deleteTestBio

public void deleteTestBio(nc.ird.cantharella.data.model.TestBio testBio)
                   throws nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataConstraintException

Supprime une manipulation de testBio

Specified by:

deleteTestBio in interface TestBioService

Parameters:

testBio - La manipulation

Throws:

nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataConstraintException - En cas de données liées

listResultatsTestBio

public List<nc.ird.cantharella.data.model.ResultatTestBio> listResultatsTestBio(nc.ird.cantharella.data.model.Utilisateur utilisateur)

Liste l'ensemble des résultats de tests biologiques selon les droits d'un utilisateur (triés par réf produit)

Specified by:

listResultatsTestBio in interface TestBioService

Parameters:

utilisateur - L'utilisateur

Returns:

la liste des résultats

listResultatsTestBioForUser

public SortedSet<nc.ird.cantharella.data.model.ResultatTestBio> listResultatsTestBioForUser(nc.ird.cantharella.data.model.Utilisateur utilisateur)

Liste l'ensemble des résultats de tests biologiques selon les droits d'un utilisateur (triés par réf produit)

Specified by:

listResultatsTestBioForUser in interface TestBioService

Parameters:

utilisateur - L'utilisateur non admin

Returns:

la liste des résultats

listProduitsTemoins

public List<String> listProduitsTemoins()

Liste les produits témoins existants pour les résultats de tests biologiques

Specified by:

listProduitsTemoins in interface TestBioService

Returns:

Les organismes

isResultatTestBioAccessibleByUser

public boolean isResultatTestBioAccessibleByUser(nc.ird.cantharella.data.model.ResultatTestBio resultatTestBio,
                                        nc.ird.cantharella.data.model.Utilisateur utilisateur)

Détermine si un utilisateur peut accéder à un résultat de test biologique

Specified by:

isResultatTestBioAccessibleByUser in interface TestBioService

Parameters:

resultatTestBio - Le résultat

utilisateur - L'utilisateur

Returns:

TRUE s'il a le droit

isResultatTestBioUniqueInList

public boolean isResultatTestBioUniqueInList(nc.ird.cantharella.data.model.ResultatTestBio resultatTestBio,
                                    List<nc.ird.cantharella.data.model.ResultatTestBio> list)

Détermine si un résultat est unique par rapport à une une liste (si blanc : unicité sur repère, si témoin : unicité sur repère + produit_témoin, si produit : unicité sur repère + produit)

Specified by:

isResultatTestBioUniqueInList in interface TestBioService

Parameters:

resultatTestBio - Le résultat de test bio

list - La liste des résultats

Returns:

TRUE

isTestBioUnique

public boolean isTestBioUnique(nc.ird.cantharella.data.model.TestBio testBio)

Vérifie si le test biologique de référence donnée est unique dans la base

Specified by:

isTestBioUnique in interface TestBioService

Parameters:

testBio - Le test biologique

Returns:

TRUE si le tet biologique est unique

loadTestBio

public nc.ird.cantharella.data.model.TestBio loadTestBio(Integer idTestBio)
                                                  throws nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataNotFoundException

Charge une manipulation de test biologique

Specified by:

loadTestBio in interface TestBioService

Parameters:

idTestBio - ID de la manipulation

Returns:

La manipulation

Throws:

nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataNotFoundException - Si non trouvée

loadTestBio

public nc.ird.cantharella.data.model.TestBio loadTestBio(String nom)
                                                  throws nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataNotFoundException

Charge une manipulation de test biologique

Specified by:

loadTestBio in interface TestBioService

Parameters:

nom - Référence de la manipulation

Returns:

La manipulation correspondante

Throws:

nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataNotFoundException - Si non trouvée

updateTestBio

public void updateTestBio(nc.ird.cantharella.data.model.TestBio testBio)
                   throws nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataConstraintException

Met à jour une manipulation de test biologique

Specified by:

updateTestBio in interface TestBioService

Parameters:

testBio - La manipulation

Throws:

nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataConstraintException - En cas de doublons (champs uniques)

refreshTestBio

public void refreshTestBio(nc.ird.cantharella.data.model.TestBio testBio)

Rafraichit une testBio (pour éviter des LazyLoadingException)

Specified by:

refreshTestBio in interface TestBioService

Parameters:

testBio - TestBio

updateOrdeleteTestBioEnabled

public boolean updateOrdeleteTestBioEnabled(nc.ird.cantharella.data.model.TestBio testBio,
                                   nc.ird.cantharella.data.model.Utilisateur utilisateur)

Détermine si un utilisateur peut modifier ou supprimer un test biologique

Specified by:

updateOrdeleteTestBioEnabled in interface TestBioService

Parameters:

testBio - La manipulation

utilisateur - L'utilisateur

Returns:

TRUE s'il a le droit

createMethodeTestBio

public void createMethodeTestBio(nc.ird.cantharella.data.model.MethodeTestBio methode)
                          throws nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataConstraintException

Créée une méthode pour un test biologique

Specified by:

createMethodeTestBio in interface TestBioService

Parameters:

methode - La méthode

Throws:

nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataConstraintException - Si la méthode (nom) existe déjà

deleteMethodeTestBio

public void deleteMethodeTestBio(nc.ird.cantharella.data.model.MethodeTestBio methode)
                          throws nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataConstraintException

Supprime une méthode pour un test biologique

Specified by:

deleteMethodeTestBio in interface TestBioService

Parameters:

methode - La méthode

Throws:

nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataConstraintException - En cas de données liées

listMethodesTestBio

public List<nc.ird.cantharella.data.model.MethodeTestBio> listMethodesTestBio()

Liste les méthodes existantes pour un test biologique (triés par nom)

Specified by:

listMethodesTestBio in interface TestBioService

Returns:

la liste des méthodes

listDomainesMethodes

public List<String> listDomainesMethodes()

Liste les domaines existants pour les méthodes de test

Specified by:

listDomainesMethodes in interface TestBioService

Returns:

Les cibles

listUnitesResultatMethodes

public List<String> listUnitesResultatMethodes()

Liste les unités de résultat existants pour les méthodes de test

Specified by:

listUnitesResultatMethodes in interface TestBioService

Returns:

Les unités

loadMethodeTest

public nc.ird.cantharella.data.model.MethodeTestBio loadMethodeTest(Integer idMethode)
                                                             throws nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataNotFoundException

Charge une méthode pour un test biologique

Specified by:

loadMethodeTest in interface TestBioService

Parameters:

idMethode - ID de la méthode

Returns:

La méthode correspondante

Throws:

nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataNotFoundException - Si non trouvée

loadMethodeTest

public nc.ird.cantharella.data.model.MethodeTestBio loadMethodeTest(String nom)
                                                             throws nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataNotFoundException

Charge une méthode pour un test biologique

Specified by:

loadMethodeTest in interface TestBioService

Parameters:

nom - Nom de la méthode

Returns:

La méthode correspondante

Throws:

nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataNotFoundException - Si non trouvée

updateMethodeTest

public void updateMethodeTest(nc.ird.cantharella.data.model.MethodeTestBio methode)
                       throws nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataConstraintException

Met à jour une méthode pour un test biologique

Specified by:

updateMethodeTest in interface TestBioService

Parameters:

methode - La méthode

Throws:

nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataConstraintException - En cas de doublons (champs uniques)

refreshMethodeTestBio

public void refreshMethodeTestBio(nc.ird.cantharella.data.model.MethodeTestBio methode)

Rafraichit une méthode de testBio (pour éviter des LazyLoadingException)

Specified by:

refreshMethodeTestBio in interface TestBioService

Parameters:

methode - La méthode

createErreurTest

public void createErreurTest(nc.ird.cantharella.data.model.ErreurTestBio erreurTest)
                      throws nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataConstraintException

Créée une erreur pour un test biologique

Specified by:

createErreurTest in interface TestBioService

Parameters:

erreurTest - L'erreur

Throws:

nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataConstraintException - Si l'erreur (nom) existe déjà

deleteErreurTest

public void deleteErreurTest(nc.ird.cantharella.data.model.ErreurTestBio erreurTest)
                      throws nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataConstraintException

Supprime une erreur pour un test biologique

Specified by:

deleteErreurTest in interface TestBioService

Parameters:

erreurTest - L'erreur

Throws:

nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataConstraintException - En cas de données liées

listErreursTestBio

public List<nc.ird.cantharella.data.model.ErreurTestBio> listErreursTestBio()

Liste les erreurs existantes pour un test biologique

Specified by:

listErreursTestBio in interface TestBioService

Returns:

la liste des erreurs

loadErreurTestBio

public nc.ird.cantharella.data.model.ErreurTestBio loadErreurTestBio(Integer idErreurTest)
                                                              throws nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataNotFoundException

Charge une erreur pour un test biologique

Specified by:

loadErreurTestBio in interface TestBioService

Parameters:

idErreurTest - ID de l'erreur

Returns:

L'erreur

Throws:

nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataNotFoundException - Si non trouvée

loadErreurTestBio

public nc.ird.cantharella.data.model.ErreurTestBio loadErreurTestBio(String nom)
                                                              throws nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataNotFoundException

Charge une erreur pour un test biologique

Specified by:

loadErreurTestBio in interface TestBioService

Parameters:

nom - Nom de l'erreur

Returns:

L'erreur

Throws:

nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataNotFoundException - Si non trouvée

updateErreurTestBio

public void updateErreurTestBio(nc.ird.cantharella.data.model.ErreurTestBio erreurTest)
                         throws nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataConstraintException

Met à jour une erreur pour un test biologique

Specified by:

updateErreurTestBio in interface TestBioService

Parameters:

erreurTest - L'erreur

Throws:

nc.ird.cantharella.data.exceptions.DataConstraintException - En cas de doublons (champs uniques)