Cette page décrit le format d'export générique.

Pour chaque fichier et colonne, on expliquera comment retrouver la données dans les écrans de l'application.

Présentation du format d'export générique

L'export générique est une archive zip composée d'un unique dossier avec les fichiers suivants :

exportCruise-100000
├── accidentalCatch.csv
├── catch.csv
├── gearCaracteristics.csv
├── individualObservation.csv
├── marineLitter.csv
├── operation.csv
├── parameter.csv
├── species.csv
└── survey.csv

Vous pouvez télécharger un exemple d'export générique.

Fichier accidentalCatch.csv

Ce fichier contient les Captures accidentelles.

Entête du fichier

Annee;Serie;Serie_Partielle;Engin;Code_station;Numero_Trait;Poche;Navire;BatchId;ReferenceTaxonId;ReferenceTaxonName;Commentaire;CaracteristicId;CaracteristicValue

Exemple

Voir le fichier accidentalCatch.csv

Description des colonnes

Nom de colonne Écran Champs Commentaire
AnneeCampagneDate de débutformat YYYY
SerieCampagneSérie
Serie_PartielleCampagneSérie partielle
EnginOpérationEngin
Code_stationOpérationCode station
Id_OperationOpérationNuméro de trait
PocheOpérationNuméro de pôche
BatchIdOpération > CaptureNuméro de lôt de captureId du lot capture
ReferenceTaxonIdOpération > Observations individuellesTableau > Espèce
ReferenceTaxonNameOpération > Observations individuellesTableau > Espèce
CommentaireOpération > Observations individuellesTableau > Commentaire
CaracteristicIdOpération > Observations individuellesTableau > Autres Caractéristiques > Caractéristique(1)
CaracteristicValueOpération > Observations individuellesTableau > Autres Caractéristiques > Valeur(1)

(1) On retrouve en plus les caractéristiques définies directement dans le tableau :

Fichier catch.csv

Ce fichier contient les données des Captures espèces et benthos.

Entête du fichier

Annee;Serie;Serie_Partielle;Engin;Code_station;Numero_Trait;Poche;Navire;Taxon;Nom_scientifique;Commentaire;V_HV;Num_Ordre_V_HV_H2;Tot_V_HV;Ech_V_HV;Type_Volume_Poids_V_HV;Unite_Volume_Poids_V_HV;Class_Tri_;Num_Ordre_Class_Tri__H2;Tot_Class_Tri_;Ech_Class_Tri_;Type_Volume_Poids_Class_Tri_;Unite_Volume_Poids_Class_Tri_;Sexe;Num_Ordre_Sexe_H2;Tot_Sexe;Ech_Sexe;Type_Volume_Poids_Sexe;Unite_Volume_Poids_Sexe;Maturité;Num_Ordre_Maturité_H2;Tot_Maturité;Ech_Maturité;Type_Volume_Poids_Maturité;Unite_Volume_Poids_Maturité;Age;Num_Ordre_Age_H2;Tot_Age;Ech_Age;Type_Volume_Poids_Age;Unite_Volume_Poids_Age;Code_Longueur;Libelle_Longueur;Taille;NumOrdre_Taille_H2;Poids_Classe_Taille;Unite_Taille;Precision_Mesure;Nbr;Poids_Reference;Coef_Elev_Espece_Capture

Exemple

Voir le fichier catch.csv

Description des colonnes

Nom de colonne Écran Champs Commentaire
AnneeCampagneDate de débutformat YYYY
SerieCampagneSérie
Serie_PartielleCampagneSérie partielle
EnginOpérationEngin
Code_stationOpérationCode station
Id_OperationOpérationNuméro de trait
PocheOpérationNuméro de pôche
EnginOpérationEngin
Code_TaxonOpération > Captures > Espèces ou BenthosTableau > Espèce
Code_Espece_CampagneOpération > Captures > Espèces ou BenthosTableau > Espèce
Nom_scientifiqueOpération > Captures > Espèces ou BenthosTableau > Espèce
CommentaireOpération > Captures > Espèces ou BenthosTableau > CommentaireLes commentaires séparés par des |; en partant du lôt père jusqu'au lot feuille
V_HVOpération > Captures > Espèces ou BenthosTableau > Poids VracValeur: Vrac ou Hors Vrac
Num_Ordre_V_HV_H2Opération > Captures > Espèces ou BenthosNuméro ordre du lot(rankOrder)
Tot_V_HVOpération > Captures > Espèces ou BenthosTableau > Vrac / Hors Vrac
Ech_V_HVOpération > Captures > Espèces ou BenthosTableau > Poids sous échantillonné
Type_Volume_Poids_V_HVOpération > Captures > Espèces ou BenthosPoids ou volume (toujours Poids)
Unite_Volume_Poids_V_HVOpération > Captures > Espèces ou BenthosUnité de poids (toujours kg)
(1)Opération > Captures > Espèces ou BenthosCatégorisations
Code_LongueurOpération > Captures > Espèces ou Benthos > MensurationsType de mesure
Libelle_LongueurOpération > Captures > Espèces ou Benthos > MensurationsType de mesure
TailleOpération > Captures > Espèces ou Benthos > MensurationsTableau > Taille
NumOrdre_Taille_H2Opération > Captures > Espèces ou Benthos > MensurationsNuméro ordre du lot(rankOrder)
Poids_Classe_TailleOpération > Captures > Espèces ou Benthos > MensurationsTableau > Poids observé
Unite_TailleOpération > Captures > Espèces ou Benthos > MensurationsType de mesure
Precision_MesureOpération > Captures > Espèces ou Benthos > MensurationsType de mesure
NbrOpération > Captures > Espèces ou Benthos > MensurationsTableau > Nombre
Poids_ReferenceOpération > Captures > Espèces ou BenthosPoids de référencePoids utilisé pour faire l'élévation
Coef_Elev_Espece_CaptureOpération > Captures > Espèces ou BenthosCoefficient d'élévation à la capture totaleValeur calculée
Coef_Final_ElevationOpération > Captures > Espèces ou BenthosCoefficient d'élévation par catégorie à la capture totaleValeur calculée à définir

(1) Comme pour V_HV; pour chaque catégorisation XXX on aura 6 colonnes :

XXX
Valeur de la catégorisation (i.e valeur de la catartéristique) (NA si cette catégorisation n'est pas utilisée)
Num_Ordre_XXX
La position du lot (technique)
Tot_XXX
Tableau > XXX
Le poids total pour tous les lots de cette catégorie
Ech_XXX
Tableau > Poids sous échantillonné
Le poids échantillon de enregistre les modifications faites dans les différents champs.
Type_Volume_Poids_XXX
Poids ou volume (toujours Poids)
Unite_Volume_Poids_XXX
Unité de poids (toujours kg)

Fichier gearCaracteristics.csv

Ce fichier contient les caractéristiques des engins d'une campagne.

Entête du fichier

Annee;Serie;Serie_Partielle;Engin;Code_PMFM;Libelle_PMFM;Valeur

Exemple

Voir le fichier gearCaracteristics.csv

Description des colonnes

Nom de colonne Écran Champs Commentaire
AnneeCampagneDate de débutformat YYYY
SerieCampagneSérie
Serie_PartielleCampagneSérie partielle
EnginCampagneEngin
Code_PMFMCampagne > EnginTableau > Caractéristique
Libelle_PMFMCampagne > EnginTableau > Caractéristique
ValeurCampagne > EnginTableau > Valeur

Fichier individualObservation.csv

Ce fichier contient les données de Observations individuelles.

Entête du fichier

Annee;Serie;Serie_Partielle;Engin;Code_station;Numero_Trait;Poche;Navire;BatchId;ReferenceTaxonId;ReferenceTaxonName;Commentaire;CaracteristicId;CaracteristicValue

Exemple

Voir le fichier individualObservation.csv

Description des colonnes

Nom de colonne Écran Champs Commentaire
AnneeCampagneDate de débutformat YYYY
SerieCampagneSérie
Serie_PartielleCampagneSérie partielle
EnginOpérationEngin
Code_stationOpérationCode station
Id_OperationOpérationNuméro de trait
PocheOpérationNuméro de pôche
EnginOpérationEngin
BatchIdOpération > Observations individuellesId technique
ReferenceTaxonIdOpération > Observations individuellesTableau > Espèce
ReferenceTaxonNameOpération > Observations individuellesTableau > Espèce
CommentaireOpération > Observations individuellesTableau > Commentaire
CaracteristicIdOpération > Observations individuellesTableau > Autre Caractéristiques > Tableau > Caractéristique(1)
CaracteristicValueOpération > Observations individuellesTableau > Autre Caractéristiques > Tableau > Valeur(1)

(1) On retrouve aussi les caractéristiques communes définies dans le protocole, affichées dans des colonnes du tableau avanat Autres caractéristiques

Fichier marineLitter.csv

Ce fichier contient les données de Macro déchets.

Entête du fichier

Annee;Serie;Serie_Partielle;Engin;Code_station;Numero_Trait;Poche;Navire;MarineLitterCategory;MarineLitterSizeCategory;Number;Weight;Commentaire

Exemple

Voir le fichier marineLitter.csv

Description des colonnes

Nom de colonne Écran Champs Commentaire
AnneeCampagneDate de débutformat YYYY
SerieCampagneSérie
Serie_PartielleCampagneSérie partielle
EnginOpérationEngin
Code_stationOpérationCode station
Id_OperationOpérationNuméro de trait
PocheOpérationNuméro de pôche
EnginOpérationEngin
MarineLitterCategoryOpération > Macro-déchetTableau > Catégorie
MarineLitterSizeCategoryOpération > Macro-déchetTableau > Catégorie de taille
NumberOpération > Macro-déchetTableau > Nombre
WeightOpération > Macro-déchetTableau > Poids
CommentaireOpération > Macro-déchetTableau > Commentaire

Fichier operation.csv

Ce fichier contient les données du Trait.

Entête du fichier

Annee;Serie;Serie_Partielle;Code_Station;Numero_Trait;Poche;Engin;Navire;DateDeb_Op;LatDeb;LongDeb;DateFin_Op;LatFin;LongFin;Duree;Strate;Sous-Strate;Localite;Validite_OP;Rectiligne;Distance;Ouv_Verticale;Ouv_Horizontale_Ailes;Ouv_Horizontale_Panneaux;Saisisseur;NavireAssocie;Commentaire;Poids_Total;Poids_Total_Calcule;Poids_Total_Vrac;Poids_Total_Vrac_Calcule;Poids_Total_HorsVrac;Poids_Total_HorsVrac_Calcule;Poids_Total_Non_Trie;Poids_Total_Non_Trie_Calcule;Poids_Total_Tremis;Poids_Total_Tremis_Calcule;Poids_Total_Carroussel;Poids_Total_Carroussel_Calcule;Poids_Total_Espece;Poids_Total_Espece_Calcule;Poids_Total_Espece_Vrac;Poids_Total_Espece_Vrac_Calcule;Poids_Total_Espece_Vrac_Trie;Poids_Total_Espece_Vrac_Trie_Calcule;Poids_Total_Espece_HorsVrac;Poids_Total_Espece_HorsVrac_Calcule;Poids_Total_Espece_Inerte_Trie;Poids_Total_Espece_Inerte_Trie_Calcule;Poids_Total_Espece_Vivant_non_detaille_trie;Poids_Total_Espece_Vivant_non_detaille_trie_Calcule;Poids_Total_Benthos;Poids_Total_Benthos_Calcule;Poids_Total_Benthos_Vrac;Poids_Total_Benthos_Vrac_Calcule;Poids_Total_Benthos_Vrac_Trie;Poids_Total_Benthos_Vrac_Trie_Calcule;Poids_Total_Benthos_HorsVrac;Poids_Total_Benthos_HorsVrac_Calcule;Poids_Total_Benthos_Inerte_Trie;Poids_Total_Benthos_Inerte_Trie_Calcule;Poids_Total_Benthos_Vivant_non_detaille_trie;Poids_Total_Benthos_Vivant_non_detaille_trie_Calcule;Poids_Total_Macro_Dechet;Poids_Total_Macro_Dechet_Calcule

Exemple

Voir le fichier operation.csv

Description des colonnes

Nom de colonne Écran Champs Commentaire
AnneeCampagneDate de débutformat YYYY
SerieCampagneSérie
Serie_PartielleCampagneSérie partielle
EnginOpérationEngin
Code_stationOpérationCode station
Id_OperationOpérationNuméro de trait
PocheOpérationNuméro de pôche
EnginOpérationEngin
NavireOpérationNavire
DateDeb_OpOpérationDate débutformat JJ/MM/YYYY HH:MM:ss
LatDebOpérationLatitude débutformat DD
LongDebOpérationLongitude débutformat DD
DateFin_OpOpérationDate finformat JJ/MM/YYYY HH:MM:ss
LatFinOpérationLatitude finformat DD
LongFinOpérationLongitude finformat DD
DureeOpérationDurée du trait(3)
StrateOpérationStrate(1)
Sous-StrateOpérationSous strate(1)
LocaliteOpérationLocalité(1)
Validite_OPOpérationOpération valide
RectiligneOpérationOpération rectiligne
DistanceOpérationDistance
SaisisseurOpérationSaisisseur(2)
NavireAssocieOpérationNavire associé(2)
CommentaireOpérationCommentaire
Poids_TotalOpération > Capture > RésuméPoids total capture(3)
Poids_Total_CalculeOpération > Capture > RésuméPoids total calculé(4)
Poids_Total_VracOpération > Capture > RésuméPoids total Vrac(3)
Poids_Total_Vrac_CalculeOpération > Capture > RésuméPoids total Vrac calculé(4)
Poids_Total_HorsVracOpération > Capture > RésuméPoids total Hors Vrac(3)
Poids_Total_HorsVrac_CalculeOpération > Capture > RésuméPoids total Hors Vrac calculé(4)
Poids_Total_Non_TrieOpération > Capture > RésuméPoids total Non trié(3)
Poids_Total_Non_Trie_CalculeOpération > Capture > RésuméPoids total Non trié calculé(4)
Poids_Total_TremisOpération > Capture > RésuméPoids total Trémis(3)
Poids_Total_Tremis_CalculeOpération > Capture > RésuméPoids total Trémis calculé(4)
Poids_Total_CarrousselOpération > Capture > RésuméPoids total Carroussel(3)
Poids_Total_Carroussel_CalculeOpération > Capture > RésuméPoids total Carroussel calculé(4)
Poids_Total_EspeceOpération > Capture > EspècePoids total(3)
Poids_Total_Espece_CalculeOpération > Capture > EspècePoids total calculé(4)
Poids_Total_Espece_VracOpération > Capture > EspècePoids total Vrac(3)
Poids_Total_Espece_Vrac_CalculeOpération > Capture > EspècePoids total Vrac calculé(4)
Poids_Total_Espece_Vrac_TrieOpération > Capture > EspècePoids total Vrac trié(3)
Poids_Total_Espece_Vrac_Trie_CalculeOpération > Capture > EspècePoids total Vrac trié calculé(4)
Poids_Total_Espece_HorsVracOpération > Capture > EspècePoids total Hors Vrac(3)
Poids_Total_Espece_HorsVrac_CalculeOpération > Capture > EspècePoids total Hors Vrac calculé(4)
Poids_Total_Espece_Inerte_TrieOpération > Capture > EspècePoids total interte trié(3)
Poids_Total_Espece_Inerte_Trie_CalculeOpération > Capture > EspècePoids total interte trié calculé(4)
Poids_Total_Espece_Vivant_non_detaille_trieOpération > Capture > EspècePoids total non détaillé trié(3)
Poids_Total_Espece_Vivant_non_detaille_trie_CalculeOpération > Capture > EspècePoids total non détaillé trié calculé(4)
Poids_Total_BenthosOpération > Capture > BenthosPoids total(3)
Poids_Total_Benthos_CalculeOpération > Capture > BenthosPoids total calculé(4)
Poids_Total_Benthos_VracOpération > Capture > BenthosPoids total Vrac(3)
Poids_Total_Benthos_Vrac_CalculeOpération > Capture > BenthosPoids total Vrac calculé(4)
Poids_Total_Benthos_Vrac_TrieOpération > Capture > BenthosPoids total Vrac trié(3)
Poids_Total_Benthos_Vrac_Trie_CalculeOpération > Capture > BenthosPoids total Vrac trié calculé(4)
Poids_Total_Benthos_HorsVracOpération > Capture > BenthosPoids total Hors Vrac(3)
Poids_Total_Benthos_HorsVrac_CalculeOpération > Capture > BenthosPoids total Hors Vrac calculé(4)
Poids_Total_Benthos_Inerte_TrieOpération > Capture > BenthosPoids total interte trié(3)
Poids_Total_Benthos_Inerte_Trie_CalculeOpération > Capture > BenthosPoids total interte trié calculé(4)
Poids_Total_Benthos_Vivant_non_detaille_trieOpération > Capture > BenthosPoids total non détaillé trié(3)
Poids_Total_Benthos_Vivant_non_detaille_trie_CalculeOpération > Capture > BenthosPoids total non détaillé trié calculé(4)
Poids_Total_Macro_DechetOpération > Capture > Macro déchetPoids total(3)
Poids_Total_Macro_Dechet_CalculeOpération > Capture > Macro déchetPoids total calculé(4)

(1) : NA si pas de valeur

(2) : Valeurs séparées par des |

(3) : -9 si pas de valeur

(4) : Y si valeur calculée, N si valeur observée

Fichier parameter.csv

Ce fichier contient tous les Caractéristiques du trait.

Entête du fichier

Annee;Serie;Serie_Partielle;Code_station;Numero_Trait;Poche;Code_PMFM;Libelle_PMFm;Valeur

Exemple

Voir le fichier parameter.csv

Description des colonnes

Nom de colonne Écran Champs Commentaire
AnneeCampagneDate de débutformat YYYY
SerieCampagneSérie
Serie_PartielleCampagneSérie partielle
EnginOpérationEngin
Code_stationOpérationCode station
Id_OperationOpérationNuméro de trait
PocheOpérationNuméro de pôche
Code_PMFMOpération > Mise en oeuvre de l'engin (ou Autres paramètres)Tableau > Caractéristique
Libelle_PMFmOpération > Mise en oeuvre de l'engin (ou Autres paramètres)Tableau > Caractéristique
ValeurOpération > Mise en oeuvre de l'engin (ou Autres paramètres)Tableau > Valeur

Fichier species.csv

Ce fichier contient l'ensemble des espèces rencontrées dans les captures du trait, à savoir :

Entête du fichier

Id;Code_Rubin;Nom Scientifique;Code campagne

Exemple

Voir le fichier species.csv

Description des colonnes

Nom de colonne Commentaire
IdIdentifiant du taxon
Code_RubinRefTaxon
Nom ScientifiqueNom scientifique
Code campagneCode campagne renseigné dans le protocole

Fichier survey.csv

Ce fichier contient les données de la Campagne.

Entête du fichier

Annee;Serie;Serie_Partielle;Navire;Pays;Zone_Etude;Campagne;Id_Sismer;Date_Deb_Campagne;Port_Deb_Campagne;Date_Fin_Campagne;Port_Fin_Campagne;Chef_Mission;Resp_Salle_Tri;Commentaire

Exemple

Voir le fichier survey.csv

Description des colonnes

Nom de colonne Écran Champs Commentaire
AnneeCampagneDate de débutformat YYYY
SerieCampagneSérie
Serie_PartielleCampagneSérie partielle
NavireCampagneNavireCode
PaysConfiguration > ApplicationId du pays à utiliser (export)
Zone_EtudeSérie de CampagneZone
CampagneCampagneNom
Id_SismerCampagneVide pour le moment (voir http://forge.codelutin.com/issues/2877)
Date_Deb_CampagneCampagneDate de débutformat JJ/MM/YYYY HH:MM:ss
Port_Deb_CampagneCampagnePort de départ
Date_Fin_CampagneCampagneDate de finformat JJ/MM/YYYY HH:MM:ss
Port_Fin_CampagneCampagnePort d'arrivée
Chef_MissionCampagneChef(s) de missionListe (séparateur |)
Resp_Salle_TriCampagneResponsable(s) de salle de triListe (séparateur |)
CommentaireCampagneCommentaire