��<!DOCTYPE html> <html lang="fr"> <head><!-- #%L Tutti :: UI %% Copyright (C) 2012 - 2014 Ifremer %% This program is free software: you can redistribute it and/or modify it under the terms of the GNU General Public License as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version. This program is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU General Public License for more details. You should have received a copy of the GNU General Public License along with this program. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0.html>. #L% --> <meta charset="utf-8"> <title>Allegro Campagne - Aide en ligne (Foire aux questions)</title> <link href="../css/bootstrap.min.css" rel="stylesheet"> <link href="../css/style.css" rel="stylesheet"> <script type="text/javascript" src="../js/jquery-2.0.3.min.js"></script> <script type="text/javascript" src="../js/bootstrap.min.js"></script> <script type="text/javascript" src="navbar.js"></script> </head> <body> <div class="container"> <div class="page-header"> <h1>Foire aux questions</h1> </div> <h2>Gestion de la saisie d'un m�lange d'esp�ces<a name="melag"></a></h2> <p>Dans le cas d'une capture abondante de plusieurs esp�ces dont les individus sont morphologiquement proches (exemple&nbsp;: m�lange de Scomber scombrus et de Scomber colias), le responsable du tri peut prendre la d�cision de ne pas trier ces esp�ces. Le m�lange d'esp�ces et mis en caisses qui sont pes�es. Le tri en esp�ces scientifique se fait dans un second temps � partir d'un �chantillon repr�sentatif tir� de plusieurs caisses r�parties sur toute la dur�e du tri. Si les sous lots ainsi obtenus sont encore trop importants, un nouvel �chantillonnage peut �tre r�alis� avant de mesurer les individus. </p> <p><span>Comment saisir cet observation dans le logiciel&nbsp;? </span></p> <pre>Exemple :<br> <span>��� </span>500 kg de MELAG, on trie 40kg en 15kg Scomber scombrus et 25kg Scomber colias. Ensuite seuls 3.5kg de Scomber scombrus et 2.3kg de Scomber colias sont mesur�s.</pre> <p><span>La saisie sera : </span></p> <ol start=1 type=1> <li>cr�er les deux lot VRAC Scomber scombrus et Scomber colias sans poids. </span></li> <li>saisir dans la colonne &quot;poids sous-�chantillonn�s (kg)&quot; les valeurs 15kg et 25kg. </span></li> <li>s�lectionner les deux lignes + clic droit et saisir la valeur du MELAG de 500kg. </span></li> <li>modifier les valeurs de la colonne &quot;poids sous-�chantillonn�s (kg)&quot; � 3.5kg et 2.3kg. </span></li> <li>finir en saisissant les valeurs des mensurations.</span></li> </ol> <p>Sur Thalassa, la gestion du m�lange peut se faire automatiquement via l'import Pupitri. Voir le chapitre sp�cifique sur l'import Pupitri </p> <h2><span>Gestion du protocole<a name="gestion_du_protocole"></a></span></h2> <p>Associer un protocole de saisie � une campagne est une �tape indispensable avant toute saisie. Le protocole permet de configurer les �crans de saisie, ce qui permet de limiter les risques d'erreurs et de faciliter la saisie (ce qui se traduit par un gain de temps). Cette �tape doit �tre r�alis�e id�alement en mode connect� car cela permet de configurer le protocole avec des r�f�rences � jour. Le protocole pourra �tre ajust� en cours de saisie. </p> <p><span>Il y a trois mani�re de pr�parer un protocole&nbsp;: </span></p> <ul type=disc> <li ><span >Cr�er un nouveau protocole (bouton <i>&nbsp;nouveau&nbsp;</i>) et compl�ter les diff�rents onglets directement sur les �crans. <br> Cette m�thode sera cependant assez longue � r�aliser. </span></li> <li ><span >Cr�er un nouveau protocole (bouton <i>&nbsp;nouveau&nbsp;</i>) et compl�ter les diff�rents onglets � partir d import de fichier <i>.csv</i> (bouton <i>&nbsp;importer les caract�ristiques&nbsp;</i> par exemple). <br> Les diff�rents fichiers .csv �tant pr�par�s et manipul�s dans un tableur (Libre office par exemple). </span></li> <li ><span >Cr�er un nouveau protocole � partir d'un protocole existant (bouton <i>&nbsp;�diter/Cloner&nbsp;</i>). <br> Le fichier � importer provenant d'un protocole existant (classiquement le protocole de la campagne de l'ann�e pr�c�dente). </span></li> </ul> <h2><span>Quelles sont les informations � renseigner dans le protocole<a name="information_dans_protocole"></a></span></h2> <h3><span>Onglet <i>&nbsp;informations g�n�rales&nbsp;</i></span></h3> <p><span>Le protocole doit porter un nom unique sur votre ordinateur. Un commentaire peut lui �tre associ�. </span></p> <h3><span>Onglet <i>&nbsp;Caract�ristiques/Classes de taille&nbsp;</i></span></h3> <p><span>S�lectionner � partir de la colonne de gauche toutes les m�thodes de mensurations appliqu�es sur les diff�rentes esp�ces observ�es au cours de la campagne. Seules les m�thodes list�es dans la colonne de droite seront disponibles dans les �crans de saisie. </span></p> <h3><span>Onglet <i>&nbsp;Caract�ristiques/Observations individuelles&nbsp;</i></span></h3> <p><span>S�lectionner � partir de la colonne de gauche toutes les caract�ristiques qui seront observ�es pour d�crire les individus. Par d�faut l'application propose le nom de l'esp�ce, son poids, sa taille et sa m�thode de mensuration. Pour pouvoir renseigner sous forme de colonnes suppl�mentaires dans le tableau, d'autres caract�ristiques, il faut les ajouter dans la colonne de droite. L'ordre des caract�ristiques (de haut en bas) sera celui appliqu� dans le tableau (de gauche � droite) </span></p> <h3><span>Onglet <i>&nbsp;Caract�ristiques/Caract�ristiques du trait&nbsp;</i></span></h3> <p><span>Dans le tableau du haut, ajouter sur chaque ligne les observations qui seront enregistr�es pour d�crire la mise en Suvre de l'engin et ou la mise en Suvre du navire (exemple&nbsp;: profondeur de l'engin, �tat de la mer). Dans la colonne �&nbsp;Onglet&nbsp;� pr�ciser l �cran dans lequel sera affich� cette caract�ristique. Dans la colonne �&nbsp;Colonne du fichier d import&nbsp;�, si vous utilisez la fonctionnalit� d import des caract�ristiques, associ� les lignes aux colonnes du fichier d import.</span></p> <p><span>Dans le tableau du bas, si vous utilisez la fonctionnalit� d import des caract�ristiques, associer les caract�ristiques du trait aux colonnes du fichier d import.</span></p> <p></p> <h3><span>Onglet <i>&nbsp;Esp�ces&nbsp;</i></span></h3> <p>Lister dans ce tableau l'ensemble des esp�ces les plus couramment observ�es, leur code associ� et l'ensemble des observations attendues (exemple&nbsp;: l'esp�ce doit-elle �tre pes�e, doit-elle �tre mesur�e&nbsp;? Si oui, quelle sera la m�thode de mesure&nbsp;?) </p> <p><strong><span>Important � retenir</span></strong><span>&nbsp;: dans la colonne <i>&nbsp;Esp�ce&nbsp;</i> seuls les taxons r�f�rents sont list�s. Si vous essayez d'importer un fichier avec des synonymes ou si vous ajoutez une ligne avec un taxon synonyme, le logiciel basculera automatiquement la ligne vers le taxon r�f�rent. </span></p> <h3><span>Onglet <i>&nbsp;Benthos&nbsp;</i></span></h3> <p><span>idem <i>&nbsp;Esp�ces&nbsp;</i> </span></p> <h3><span>Information importante</span></h3> <p>le logiciel permet une saisie s�par�e des fractions <i>&nbsp;Esp�ces&nbsp;</i> et <i>&nbsp;Benthos&nbsp;</i>. Cette s�paration permet l'enregistrement de taux d'�chantillonnages diff�rents entre ces deux fractions. </p> <p>Dans le cas o� le protocole de la campagne entra�ne une observation commune des deux fractions, la saisie des esp�ces et du benthos pourra �tre r�alis�e sur le m�me tableau. Dans ce dernier cas, ne pas utiliser la notion de benthos (comme esp�ce temporaire) dans le logiciel. M�me chose pour les m�duses qui appartiennent normalement au groupe Plancton. </p> <h2><span>Format des fichiers d'imports dans le logiciel<a name="format_fichier_import"></a></span></h2> <p>Afin de conna�tre le format des diff�rents fichiers qu'il est possible d'importer dans le logiciel, l'utilisateur est invit� � ajouter une ou plusieurs valeurs � partir des �crans puis � exporter le r�sultat. Le fichier ainsi cr�� sera ouvert dans un �diteur de texte (Libre Office id�alement) pour prendre connaissance du format du fichier. L'utilisateur peut alors modifier le fichier selon son besoin avant de l'importer dans le logiciel. </p> <h2><span>Manipulation des fichiers d'import/export<a name="manipulation_fichiers"></a></span></h2> <p>Le logiciel g�n�re et importe deux formats de fichiers.</p> <ol start=1 type=1> <li ><span >des format propres au logiciel (exemple&nbsp;: export du protocole � partir du menu �diter/Exporter en face du champ Protocole de saisie). <br> Ces fichiers peuvent �tre ouverts et modifi�s � partir d'un �diteur de type Notepad++). <br> La syntaxe est cependant difficilement compr�hensible pour un utilisateur normal du logiciel. Ces fichiers serviront donc le plus souvent d'export/import sans modification du contenu. </span></li> <li ><span >des formats <i>.csv</i>. Ces fichiers sont � ouvrir sous Libre Office et � sauvegarder en respectant le formatage suivant&nbsp;: Encodage de caract�re UTF8 et s�parateur de champ <i>&nbsp;;&nbsp;</i>. Ces fichiers sont facilement compr�hensibles par les utilisateurs et peuvent donc �tre modifi�s avant import dans le logiciel. </span></li> </ol> <h2><span>Sauvegarde du protocole dans Harmonie<a name="sauvegarde_protocole"></a> </span></h2> <p>Avant synchronisation vers Harmonie, exporter le protocole de la campagne et l'importer comme pi�ce jointe associ� au premier trait de la campagne afin de le sauvegarder. <br> Cela vous permettra de le r�cup�rer l'ann�e suivante pour initialiser la nouvelle campagne et/ou corriger les donn�es. </p> <h2><span>Vrac / Hors Vrac : d�finitions<a name="vrac_definition"></a></span></h2> <p><span>HORS VRAC</span></p> <p><span >cat�gorie associ�e � un lot ou un individu qui a �t� pr�lev� directement sur la capture sans passer par le pesage automatique ni le tri. </span></p> <p><span>Cas 1</span></p> <p><span >Cette notion est utile dans les cas de capture abondante o� seule une fraction de la capture va �tre observ�e. Dans cette configuration, les lots (cat�goris�s � VRAC) observ�s dans l'�chantillon seront �lev�s (facteur d'�l�vation) pour obtenir les poids et nombre totaux dans la capture. </span></p> <p><span>Cas 2</span></p> <p><span >Les individus rares ou atypiques qui auront �t� extraits de la capture avant �chantillonnage ne devront pas �tre �lev�s car leur facteur d'�l�vation = 1. </span></p> <p><span>Cas 3</span></p> <p><span >par convention, lorsque la totalit� de la capture est observ�e (pes�e et tri�e), on cat�gorise tous les lots � VRAC. </span></p> <h2><span>Saisie multi-ordinateurs<a name="saisie_multiposte"></a></span></h2> <p>L'applicatif permet d'envisager la saisie des informations sur plusieurs ordinateurs en parall�le. Par exemple, pour acc�l�rer le temps de saisie, il est possible de saisir la composition du benthos sur un ordinateur et toutes les autres informations (les esp�ces, les macro-d�chets etc.) sur un autre ordinateur. Il faut cependant d�cider � l'avance quel sera l'ordinateur dit <i>&nbsp;ma�tre&nbsp;</i> et le(s) ordinateur(s) <i>&nbsp;satellites&nbsp;</i>. L'ordinateur <i>&nbsp;ma�tre&nbsp;</i> centralisera toutes les donn�es alors que les ordinateurs <i>&nbsp;satellites&nbsp;</i> ne seront utilis�s que pour saisir une parties des fractions de la capture. </p> <p>Pour cela il faut initialiser la saisie sur le poste <i>&nbsp;ma�tre&nbsp;</i> (d�finir la s�rie, la campagne et le protocole). Exporter la base dans le menu Fichier/Gestionnaire de base...Exporter. Sur les postes <i>&nbsp;satellites&nbsp;</i>, lancer l'installation de l'applicatif en pointant sur la base ainsi export�e. </p> <p>Pour la saisie sur les postes <i>&nbsp;satellites&nbsp;</i>, cr�er les traits en ne compl�tant que les trois champs <i>&nbsp;Code station&nbsp;</i>, <i>&nbsp;Num�ro de trait&nbsp;</i> et <i>&nbsp;date de d�but de tra�ne&nbsp;</i>. Compl�ter les donn�es sur l'onglet appropri� (exemple Benthos). </p> <p>En haut � gauche de l'�cran utiliser l'option <i>&nbsp;exporter les ...&nbsp;</i>. </p> <p>Enregistrer le fichier sur le r�seau ou sur une clef usb. </p> <p>Sur le poste <i>&nbsp;ma�tre&nbsp;</i>, se positionner sur le bon trait et l'onglet que vous souhaitez importer. </p> <p>En haut � droite de l'�cran cliquer sur <i>&nbsp;Importer des ...&nbsp;</i>, pointer sur le fichier pr�c�demment g�n�r�. </p> <p>Toutes les donn�es saisie sur le poste satellite sont rapatri�es sur le poste <i>&nbsp;ma�tre&nbsp;</i>. </p> <p>Fonctionnement de l'import de donn�es : seuls les champs non renseign�s dans l'�cran d'import peuvent �tre compl�t�s par les donn�es du fichier import�. </p> <p>Les poids saisis dans l'�cran d'import et les esp�ces saisies dans l'�cran ne pourront pas �tre �cras�s par le fichier import�. </p> <p>Les donn�es non import�es seront list�es. Ainsi, les donn�es saisies sur le poste <i>&nbsp;ma�tre&nbsp;</i> sont prioritaires sur les importations des postes <i>&nbsp;satellites&nbsp;</i> et ne seront donc pas �cras�es. </p> <h2><span>Sauvegarde r�guli�re de la base<a name="sauvegarde_reguliere"></a></span></h2> <p>L'application utilise une base de donn�es qui peut �tre sensible � des erreurs machine. Il est donc n�cessaire de r�aliser des sauvegardes r�guli�res (tous les soirs) de la base afin de se pr�munir de toutes pertes de donn�es. Pour cela utiliser l'option &quot;Exporter&quot; du menu &quot;Fichier/Gestionnaire de base&quot;. Le r�pertoire de sauvegarde de la base est d�fini dans le menu &quot;Fichier/Configuration/Technique/R�pertoire de sauvegarde de base&quot;. </p> </div> </body> </html>